Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB40BQ12829 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms