Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCB1Q12824 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCB1Q12824 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCB1Q12824 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCB1Q12824 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCB1Q12824 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCB1Q12824 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCB1Q12824 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCB1Q12824 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCB1Q12824 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCB1Q12824 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCB1Q12824 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCB1Q12824 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCB1Q12824 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCB1Q12824 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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