Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 BCH1YMR237W 2175 nt3.64□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 MYO3YKL129C 3819 nt3.64□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 DNA2YHR164C 4569 nt3.64□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 YAK1YJL141C 2424 nt3.64□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.63□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 NTO1YPR031W 2247 nt3.63□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 RPS17BYDR447C 411 nt3.63□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt3.63□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 RPL33AYPL143W 324 nt3.63□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 LEU3YLR451W 2661 nt3.63□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 YJL070CYJL070C 2667 nt3.62□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt3.62□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 PAN3YKL025C 2040 nt3.61□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 OST4YDL232W 111 nt3.61□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 ALK2YBL009W 2031 nt3.61□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 SIP3YNL257C 3690 nt3.6□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 snR70snR70 164 nt3.6□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 YOR218CYOR218C 420 nt3.6□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 NPR1YNL183C 2373 nt3.6□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 DOT6YER088C 2013 nt3.6□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 APL5YPL195W 2799 nt3.59□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 MCM10YIL150C 1716 nt3.59□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 RPB2YOR151C 3675 nt3.59□□□□□ -1.83
SRF1Q12516 PTC5YOR090C 1719 nt3.58□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 SPO75YLL005C 2607 nt3.58□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 SAK1YER129W 3429 nt3.57□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 CHD1YER164W 4407 nt3.57□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 YTA7YGR270W 4140 nt3.57□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 SLN1YIL147C 3663 nt3.57□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 YBR174CYBR174C 315 nt3.57□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 MTC4YBR255W 2085 nt3.57□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 PIM1YBL022C 3402 nt3.57□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 FAS1YKL182W 6156 nt3.57□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 KAP95YLR347C 2586 nt3.57□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 YDL242WYDL242W 354 nt3.56□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 RAM2YKL019W 951 nt3.56□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 UBP1YDL122W 2430 nt3.56□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 INP2YMR163C 2118 nt3.56□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 NAB3YPL190C 2409 nt3.55□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 RIX1YHR197W 2292 nt3.55□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 SRO7YPR032W 3102 nt3.55□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.55□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.55□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.55□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.55□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.55□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 YCL019WYCL019W 5313 nt3.55□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 YME2YMR302C 2553 nt3.55□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 XRN1YGL173C 4587 nt3.54□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 POM152YMR129W 4014 nt3.54□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 RLI1YDR091C 1827 nt3.54□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 YMR31YFR049W 372 nt3.54□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 YBL065WYBL065W 345 nt3.54□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt3.54□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 YBR206WYBR206W 324 nt3.54□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 VMA1YDL185W 3216 nt3.54□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 PEP3YLR148W 2757 nt3.54□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 YCF1YDR135C 4548 nt3.54□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 NIP100YPL174C 2607 nt3.54□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 EXO84YBR102C 2262 nt3.53□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt3.53□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 CDC31YOR257W 486 nt3.53□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 RTC6YPL183W-A 282 nt3.53□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 RRM3YHR031C 2172 nt3.53□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 ECM21YBL101C 3354 nt3.53□□□□□ -1.84
SRF1Q12516 DIA2YOR080W 2199 nt3.52□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 RPL25YOL127W 429 nt3.52□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 ENA2YDR039C 3276 nt3.52□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 ENA1YDR040C 3276 nt3.52□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 STE11YLR362W 2154 nt3.52□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 MDN1YLR106C 14733 nt3.52□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 IKI3YLR384C 4050 nt3.52□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 COG3YER157W 2406 nt3.51□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 NOC3YLR002C 1992 nt3.51□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 EFR3YMR212C 2349 nt3.51□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 RRP5YMR229C 5190 nt3.51□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 TFC1YBR123C 1950 nt3.51□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 ZDS1YMR273C 2748 nt3.5□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 PSK1YAL017W 4071 nt3.5□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 YDL196WYDL196W 330 nt3.5□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 PSO2YMR137C 1986 nt3.5□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 DUF1YOL087C 3351 nt3.5□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 AHC1YOR023C 1701 nt3.5□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 PFF1YBR074W 2931 nt3.5□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 SGS1YMR190C 4344 nt3.49□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 ENA5YDR038C 3276 nt3.49□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 YPL044CYPL044C 549 nt3.49□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 NCA2YPR155C 1851 nt3.49□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 ZIP1YDR285W 2628 nt3.48□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 TRS120YDR407C 3870 nt3.48□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt3.48□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 YGR050CYGR050C 357 nt3.48□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 GRX8YLR364W 330 nt3.48□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 ATG11YPR049C 3537 nt3.48□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 YMR317WYMR317W 3423 nt3.48□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 HEF3YNL014W 3135 nt3.47□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 RPA135YPR010C 3612 nt3.47□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 SQS1YNL224C 2304 nt3.47□□□□□ -1.85
SRF1Q12516 SGD1YLR336C 2700 nt3.46□□□□□ -1.86
SRF1Q12516 ABP140YOR239W 1887 nt3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.3 ms