Protein–RNA interactions for Protein: Q12402

YOP1, Protein YOP1, yeastyeast

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOP1Q12402 SUP56tL(CAA)A 82 nt1.67□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 SUP53tL(CAA)C 82 nt1.67□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt1.67□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt1.67□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 SUP54tL(CAA)G2 82 nt1.67□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt1.67□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt1.67□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt1.67□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt1.67□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt1.67□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 PRM3YPL192C 402 nt1.67□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 MKT1YNL085W 2493 nt1.67□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 HCS1YKL017C 2052 nt1.67□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 ZRG8YER033C 3231 nt1.66□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.66□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.66□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 YGR042WYGR042W 816 nt1.66□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 YPL238CYPL238C 390 nt1.66□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 YNL144CYNL144C 2223 nt1.66□□□□□ -2.14
YOP1Q12402 CGI121YML036W 546 nt1.65□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 YPR177CYPR177C 372 nt1.65□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.64□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 PAN3YKL025C 2040 nt1.64□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 MYO4YAL029C 4416 nt1.64□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 LHS1YKL073W 2646 nt1.64□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.64□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.64□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 YLR287CYLR287C 1068 nt1.64□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.64□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.64□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 RPL36BYPL249C-A 303 nt1.64□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 DIE2YGR227W 1578 nt1.64□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 PDR3YBL005W 2931 nt1.63□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 GNT1YOR320C 1476 nt1.63□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 CBS1YDL069C 690 nt1.63□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 GCN4YEL009C 846 nt1.63□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 RPL42BYHR141C 321 nt1.63□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 UBC7YMR022W 498 nt1.63□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 RPL42AYNL162W 321 nt1.63□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.63□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 SSQ1YLR369W 1974 nt1.63□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 HIR3YJR140C 4947 nt1.62□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 YDR114CYDR114C 303 nt1.62□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 YGL239CYGL239C 315 nt1.62□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 ALK2YBL009W 2031 nt1.62□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 SDH7YDR511W 402 nt1.61□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.61□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 AGA2YGL032C 264 nt1.61□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.61□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 RPA34YJL148W 702 nt1.61□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 YBL071CYBL071C 309 nt1.61□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 IRR1YIL026C 3453 nt1.61□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 TOF2YKR010C 2316 nt1.61□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 PKH3YDR466W 2697 nt1.61□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 RTP1YMR185W 2946 nt1.6□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 YJR098CYJR098C 1971 nt1.6□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 FYV12YOR183W 390 nt1.6□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 YJR039WYJR039W 3366 nt1.6□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 SEC63YOR254C 1992 nt1.59□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 RTT102YGR275W 474 nt1.59□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 YNL114CYNL114C 372 nt1.59□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 MRPL50YNR022C 420 nt1.59□□□□□ -2.15
YOP1Q12402 NUP170YBL079W 4509 nt1.59□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 MSC6YOR354C 2079 nt1.59□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 YGR250CYGR250C 2346 nt1.58□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 BPH1YCR032W 6504 nt1.58□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 UBR2YLR024C 5619 nt1.58□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 TFC8YPL007C 1767 nt1.58□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 YDR008CYDR008C 351 nt1.58□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.58□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 MCM22YJR135C 720 nt1.58□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 PRE8YML092C 753 nt1.58□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 YPL182CYPL182C 384 nt1.58□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 SEY1YOR165W 2331 nt1.58□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 HSH155YMR288W 2916 nt1.58□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 MSH6YDR097C 3729 nt1.57□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.57□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.57□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.57□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 RPS24BYIL069C 408 nt1.57□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 PAU14YIL176C 363 nt1.57□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 PAU1YJL223C 363 nt1.57□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 YKL202WYKL202W 582 nt1.57□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 SBE22YHR103W 2559 nt1.56□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 HSL1YKL101W 4557 nt1.56□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 YER079WYER079W 633 nt1.56□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 ABM1YJR108W 372 nt1.56□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 PAU18YLL064C 363 nt1.56□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 YBL073WYBL073W 312 nt1.56□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 RPL32YBL092W 393 nt1.56□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 PAU6YNR076W 363 nt1.56□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 YCL046WYCL046W 324 nt1.56□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 IRE1YHR079C 3348 nt1.56□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 WIP1YDR374W-A 270 nt1.55□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 RRT1YBL048W 312 nt1.55□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 YOL159CYOL159C 516 nt1.55□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 YOR146WYOR146W 306 nt1.55□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 FMP23YBR047W 528 nt1.55□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 SAR1YPL218W 573 nt1.55□□□□□ -2.16
YOP1Q12402 CTR9YOL145C 3234 nt1.55□□□□□ -2.16
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