Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 YJL070CYJL070C 2667 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 SEC7YDR170C 6030 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 SNF5YBR289W 2718 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 PRE4YFR050C 801 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 ERP6YGL002W 651 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 MPH1YIR002C 2982 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 GRX8YLR364W 330 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 NUT2YPR168W 474 nt2.61□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 YGR164WYGR164W 336 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 YLR255CYLR255C 354 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 ROG1YGL144C 2058 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 ESL1YIL151C 3357 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 TMN3YER113C 2121 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 YPR089WYPR089W 2667 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 UBP11YKR098C 2154 nt2.6□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 CDC27YBL084C 2277 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 CYR1YJL005W 6081 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 RPL6AYML073C 531 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 RGM1YMR182C 636 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 LSM7YNL147W 348 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 SNC2YOR327C 348 nt2.59□□□□□ -1.99
TRM13Q12383 RPA190YOR341W 4995 nt2.59□□□□□ -2
TRM13Q12383 DNL4YOR005C 2835 nt2.58□□□□□ -2
TRM13Q12383 JSN1YJR091C 3276 nt2.58□□□□□ -2
TRM13Q12383 UPS1YLR193C 528 nt2.58□□□□□ -2
TRM13Q12383 YML037CYML037C 1023 nt2.58□□□□□ -2
TRM13Q12383 YOR333CYOR333C 417 nt2.58□□□□□ -2
TRM13Q12383 SEC5YDR166C 2916 nt2.58□□□□□ -2
TRM13Q12383 SAK1YER129W 3429 nt2.58□□□□□ -2
TRM13Q12383 SMY1YKL079W 1971 nt2.58□□□□□ -2
TRM13Q12383 SSS1YDR086C 243 nt2.57□□□□□ -2
TRM13Q12383 PNC1YGL037C 651 nt2.57□□□□□ -2
TRM13Q12383 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.57□□□□□ -2
TRM13Q12383 COA4YLR218C 453 nt2.57□□□□□ -2
TRM13Q12383 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.57□□□□□ -2
TRM13Q12383 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.56□□□□□ -2
TRM13Q12383 HEH2YDR458C 1992 nt2.56□□□□□ -2
TRM13Q12383 SPT21YMR179W 2277 nt2.56□□□□□ -2
TRM13Q12383 MRP10YDL045W-A 288 nt2.56□□□□□ -2
TRM13Q12383 YDR286CYDR286C 345 nt2.56□□□□□ -2
TRM13Q12383 PHO2YDL106C 1680 nt2.56□□□□□ -2
TRM13Q12383 YGR067CYGR067C 2415 nt2.56□□□□□ -2
TRM13Q12383 FMP16YDR070C 282 nt2.55□□□□□ -2
TRM13Q12383 MET6YER091C 2304 nt2.55□□□□□ -2
TRM13Q12383 YBL083CYBL083C 426 nt2.55□□□□□ -2
TRM13Q12383 YOR015WYOR015W 360 nt2.55□□□□□ -2
TRM13Q12383 RTT10YPL183C 3042 nt2.55□□□□□ -2
TRM13Q12383 PFF1YBR074W 2931 nt2.55□□□□□ -2
TRM13Q12383 YPR092WYPR092W 306 nt2.55□□□□□ -2
TRM13Q12383 YBR184WYBR184W 1572 nt2.55□□□□□ -2
TRM13Q12383 snR48snR48 113 nt2.55□□□□□ -2
TRM13Q12383 YIL169CYIL169C 2988 nt2.55□□□□□ -2
TRM13Q12383 YOR376WYOR376W 369 nt2.54□□□□□ -2
TRM13Q12383 KAP123YER110C 3342 nt2.54□□□□□ -2
TRM13Q12383 LRE1YCL051W 1752 nt2.54□□□□□ -2
TRM13Q12383 DUG2YBR281C 2637 nt2.54□□□□□ -2
TRM13Q12383 VPS35YJL154C 2835 nt2.53□□□□□ -2
TRM13Q12383 STE6YKL209C 3873 nt2.53□□□□□ -2
TRM13Q12383 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.53□□□□□ -2
TRM13Q12383 COX14YML129C 213 nt2.53□□□□□ -2
TRM13Q12383 RPL20AYMR242C 519 nt2.53□□□□□ -2
TRM13Q12383 PRP6YBR055C 2700 nt2.53□□□□□ -2
TRM13Q12383 YDR186CYDR186C 2634 nt2.53□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 PLC1YPL268W 2610 nt2.53□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 SEF1YBL066C 3447 nt2.52□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 RGC1YPR115W 3252 nt2.52□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 RRP12YPL012W 3687 nt2.52□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 snR52snR52 92 nt2.52□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 SWI6YLR182W 2412 nt2.52□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 GRR1YJR090C 3456 nt2.52□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 MUK1YPL070W 1839 nt2.52□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 INP2YMR163C 2118 nt2.51□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 GCV2YMR189W 3105 nt2.51□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 VPS54YDR027C 2670 nt2.51□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 VPS34YLR240W 2628 nt2.51□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 YIL174WYIL174W 228 nt2.51□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.51□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 COF1YLL050C 432 nt2.51□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 ECM21YBL101C 3354 nt2.51□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 RIC1YLR039C 3171 nt2.51□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 SSQ1YLR369W 1974 nt2.5□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 YLR149CYLR149C 2193 nt2.5□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 HSC82YMR186W 2118 nt2.5□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 YDR209CYDR209C 414 nt2.5□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 YGL217CYGL217C 342 nt2.5□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 SMD1YGR074W 441 nt2.5□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 RPS22AYJL190C 393 nt2.5□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 NUP120YKL057C 3114 nt2.5□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 NOP53YPL146C 1368 nt2.49□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 MDM20YOL076W 2391 nt2.49□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 VTC1YER072W 390 nt2.49□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 ULI1YFR026C 510 nt2.49□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 RPS12YOR369C 432 nt2.49□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 RPL33AYPL143W 324 nt2.49□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 snR43snR43 209 nt2.49□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 FIR1YER032W 2631 nt2.49□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 KEL2YGR238C 2649 nt2.49□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 ILS1YBL076C 3219 nt2.49□□□□□ -2.01
TRM13Q12383 PEP3YLR148W 2757 nt2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 51.5 ms