Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RASGEF1BQ0VAM2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms