Protein–RNA interactions for Protein: Q08968

FMP40, UPF0061 protein FMP40, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FMP40Q08968 RTT107YHR154W 3213 nt2.08□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 TUS1YLR425W 3924 nt2.08□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 SAP185YJL098W 3177 nt2.08□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 YLR053CYLR053C 327 nt2.08□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.08□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 IRC8YJL051W 2469 nt2.08□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 TRL1YJL087C 2484 nt2.08□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 RBK1YCR036W 1002 nt2.07□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 YPR099CYPR099C 357 nt2.07□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 SET2YJL168C 2202 nt2.07□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 SCH9YHR205W 2475 nt2.07□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 DOT6YER088C 2013 nt2.07□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 PEP3YLR148W 2757 nt2.06□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 YDL152WYDL152W 366 nt2.06□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 VPS8YAL002W 3825 nt2.06□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 TMA10YLR327C 261 nt2.06□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 YPL261CYPL261C 309 nt2.06□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 YMR045CYMR045C 5268 nt2.06□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 GNT1YOR320C 1476 nt2.06□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 ATG31YDR022C 591 nt2.05□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 VTC1YER072W 390 nt2.05□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 YGL239CYGL239C 315 nt2.05□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.05□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 YBL083CYBL083C 426 nt2.05□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 YPL182CYPL182C 384 nt2.05□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 DAS1YJL149W 1992 nt2.05□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 MNL2YLR057W 2550 nt2.04□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 WIP1YDR374W-A 270 nt2.04□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.04□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 SMY1YKL079W 1971 nt2.04□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 YAR047CYAR047C 321 nt2.04□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 IST2YBR086C 2841 nt2.04□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 RTT101YJL047C 2529 nt2.03□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 SPP41YDR464W 4308 nt2.03□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 YDL011CYDL011C 324 nt2.03□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 YDL062WYDL062W 426 nt2.03□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 GCN2YDR283C 4980 nt2.03□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 PAN3YKL025C 2040 nt2.03□□□□□ -2.08
FMP40Q08968 YDR341CYDR341C 1824 nt2.03□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 SEF1YBL066C 3447 nt2.03□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 CHC1YGL206C 4962 nt2.02□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 DIS3YOL021C 3006 nt2.02□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 GIM4YEL003W 336 nt2.02□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt2.02□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt2.02□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.02□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 PGA1YNL158W 597 nt2.02□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 CDC60YPL160W 3273 nt2.02□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 YBR184WYBR184W 1572 nt2.02□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 TOR2YKL203C 7425 nt2.01□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 TFC3YAL001C 3483 nt2.01□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.01□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 SLM1YIL105C 2061 nt2.01□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 UTP22YGR090W 3714 nt2.01□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 NOP14YDL148C 2433 nt2.01□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 UFD4YKL010C 4452 nt2.01□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 YFR016CYFR016C 3702 nt2.01□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 SYH1YPL105C 2550 nt2□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 YCR043CYCR043C 384 nt2□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 RPL37BYDR500C 267 nt2□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 YEL057CYEL057C 702 nt2□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 HIT1YJR055W 495 nt2□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 RPL9BYNL067W 576 nt2□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 CYB5YNL111C 363 nt2□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 YOR121CYOR121C 306 nt2□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 GRR1YJR090C 3456 nt2□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 SNF5YBR289W 2718 nt1.99□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 PLC1YPL268W 2610 nt1.99□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 TOF2YKR010C 2316 nt1.99□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 GCN4YEL009C 846 nt1.99□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 UBP1YDL122W 2430 nt1.99□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt1.98□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 PUT3YKL015W 2940 nt1.98□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 SIR4YDR227W 4077 nt1.98□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 ZRG8YER033C 3231 nt1.98□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 IRR1YIL026C 3453 nt1.97□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 YAP6YDR259C 1152 nt1.97□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.97□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 RPA34YJL148W 702 nt1.97□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 RPL32YBL092W 393 nt1.97□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 YOR029WYOR029W 336 nt1.97□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 YBR012CYBR012C 420 nt1.97□□□□□ -2.09
FMP40Q08968 RPL26AYLR344W 384 nt1.96□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 ARP7YPR034W 1434 nt1.96□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 ALK2YBL009W 2031 nt1.96□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 NAM7YMR080C 2916 nt1.96□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 AGC1YPR021C 2709 nt1.96□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 BUD2YKL092C 3315 nt1.95□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 FKS1YLR342W 5631 nt1.95□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.95□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 YDR008CYDR008C 351 nt1.95□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 TIM13YGR181W 318 nt1.95□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.95□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 CGI121YML036W 546 nt1.95□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 YNL114CYNL114C 372 nt1.95□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 UBP2YOR124C 3819 nt1.95□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 RPH1YER169W 2391 nt1.95□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.94□□□□□ -2.1
FMP40Q08968 MGA2YIR033W 3342 nt1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24 ms