Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSRP1Q08945 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms