Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB2Q08289 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB2Q08289 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms