Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms