Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OCA2Q04671 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
OCA2Q04671 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
OCA2Q04671 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
OCA2Q04671 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OCA2Q04671 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OCA2Q04671 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OCA2Q04671 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OCA2Q04671 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OCA2Q04671 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OCA2Q04671 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OCA2Q04671 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OCA2Q04671 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OCA2Q04671 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OCA2Q04671 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OCA2Q04671 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms