Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 YML084WYML084W 309 nt2.11□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 PGA1YNL158W 597 nt2.11□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 TDA9YML081W 3756 nt2.1□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 BRR2YER172C 6492 nt2.1□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YSW1YBR148W 1830 nt2.1□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 CFT1YDR301W 4074 nt2.1□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 MSS11YMR164C 2277 nt2.1□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 ATP17YDR377W 306 nt2.1□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YLR101CYLR101C 396 nt2.1□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 COX7YMR256C 183 nt2.1□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YPR039WYPR039W 336 nt2.1□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 KAR3YPR141C 2190 nt2.1□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 VPS34YLR240W 2628 nt2.1□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 PET309YLR067C 2898 nt2.1□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 UBP2YOR124C 3819 nt2.1□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YLR149CYLR149C 2193 nt2.09□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 HSK3YKL138C-A 210 nt2.09□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 TIF11YMR260C 462 nt2.09□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 PRM3YPL192C 402 nt2.09□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 MGA2YIR033W 3342 nt2.08□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 YHR210CYHR210C 1026 nt2.08□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 RRT1YBL048W 312 nt2.08□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 CYB5YNL111C 363 nt2.08□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 snR13snR13 124 nt2.08□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 YPR177CYPR177C 372 nt2.08□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 CFT2YLR115W 2580 nt2.08□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 snR79snR79 84 nt2.07□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 YER121WYER121W 345 nt2.07□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 YFL019CYFL019C 354 nt2.07□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 YGR025WYGR025W 303 nt2.07□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.07□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 YBR032WYBR032W 303 nt2.07□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 HCS1YKL017C 2052 nt2.06□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 NOT5YPR072W 1683 nt2.06□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 YDL118WYDL118W 381 nt2.06□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.06□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 RPA34YJL148W 702 nt2.06□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.06□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.06□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 MNL2YLR057W 2550 nt2.06□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 VMR1YHL035C 4779 nt2.05□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 RBK1YCR036W 1002 nt2.05□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 YDR114CYDR114C 303 nt2.05□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 RPS18BYML026C 441 nt2.05□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 COA6YMR244C-A 315 nt2.05□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 CDC24YAL041W 2565 nt2.05□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 SEY1YOR165W 2331 nt2.05□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 PLC1YPL268W 2610 nt2.04□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 ZRG8YER033C 3231 nt2.04□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 TMA7YLR262C-A 195 nt2.04□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 CMC2YBL059C-A 330 nt2.04□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 CDC33YOL139C 642 nt2.04□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.03□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 HUR1YGL168W 333 nt2.03□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 SMY1YKL079W 1971 nt2.03□□□□□ -2.08
SYF1Q04048 SLM1YIL105C 2061 nt2.02□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 YER135CYER135C 393 nt2.02□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 FCF2YLR051C 654 nt2.02□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 YPL238CYPL238C 390 nt2.02□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 GCN2YDR283C 4980 nt2.02□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.02□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 PEP3YLR148W 2757 nt2.02□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 YCR043CYCR043C 384 nt2.01□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.01□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.01□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 YBR224WYBR224W 516 nt2.01□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 COX1Q0045 1605 nt2.01□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 DAS1YJL149W 1992 nt2□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 BTT1YDR252W 450 nt2□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 AGA2YGL032C 264 nt2□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 YBL083CYBL083C 426 nt2□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 ZEO1YOL109W 342 nt2□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 DOT6YER088C 2013 nt2□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1.99□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 EGD1YPL037C 474 nt1.99□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 SEC63YOR254C 1992 nt1.99□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 CAT8YMR280C 4302 nt1.99□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 CHS1YNL192W 3396 nt1.98□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 LRE1YCL051W 1752 nt1.98□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.98□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.98□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 CDC31YOR257W 486 nt1.98□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 CHC1YGL206C 4962 nt1.98□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 SNF5YBR289W 2718 nt1.97□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 IRR1YIL026C 3453 nt1.97□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 YOR093CYOR093C 4947 nt1.97□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 CRG1YHR209W 876 nt1.97□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 ERP4YOR016C 624 nt1.97□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 YPR146CYPR146C 330 nt1.97□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 PIP2YOR363C 2991 nt1.97□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 YBR184WYBR184W 1572 nt1.97□□□□□ -2.09
SYF1Q04048 YMR045CYMR045C 5268 nt1.96□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 MSH3YCR092C 3057 nt1.96□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 MSH6YDR097C 3729 nt1.95□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 SPO23YBR250W 1572 nt1.95□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 YDR157WYDR157W 402 nt1.95□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 TMA22YJR014W 597 nt1.95□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.95□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 YJR039WYJR039W 3366 nt1.94□□□□□ -2.1
SYF1Q04048 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.94□□□□□ -2.1
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