Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
ERCC6Q03468 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
ERCC6Q03468 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms