Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPCQ03188 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms