Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLOD1Q02809 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms