Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APBA1Q02410 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms