Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OTUD4Q01804 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OTUD4Q01804 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms