Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DEFA6Q01524 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DEFA6Q01524 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms