Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTBN1Q01082 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms