Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CLTCQ00610 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CLTCQ00610 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLTCQ00610 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms