Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms