Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXC5Q00444 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms