Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDLBPQ00341 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HDLBPQ00341 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDLBPQ00341 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms