Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTA1P68133 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms