Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBE2L3P68036 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms