Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM4P67936 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM4P67936 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM4P67936 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM4P67936 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM4P67936 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM4P67936 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM4P67936 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM4P67936 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM4P67936 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM4P67936 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM4P67936 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM4P67936 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM4P67936 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM4P67936 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM4P67936 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms