Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HERVK_113P63121 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms