Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2FP61218 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms