Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVFC1P60507 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms