Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCCD1P59942 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms