Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms