Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX3P56589 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX3P56589 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX3P56589 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX3P56589 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX3P56589 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX3P56589 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX3P56589 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX3P56589 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX3P56589 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX3P56589 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX3P56589 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX3P56589 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX3P56589 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX3P56589 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PEX3P56589 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX3P56589 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX3P56589 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX3P56589 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX3P56589 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX3P56589 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PEX3P56589 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX3P56589 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX3P56589 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX3P56589 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX3P56589 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX3P56589 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX3P56589 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PEX3P56589 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PEX3P56589 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX3P56589 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX3P56589 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX3P56589 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX3P56589 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX3P56589 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX3P56589 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX3P56589 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX3P56589 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX3P56589 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX3P56589 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX3P56589 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX3P56589 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX3P56589 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX3P56589 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PEX3P56589 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PEX3P56589 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX3P56589 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX3P56589 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX3P56589 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX3P56589 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX3P56589 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX3P56589 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX3P56589 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX3P56589 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX3P56589 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX3P56589 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX3P56589 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX3P56589 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PEX3P56589 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 315.3 ms