Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ATP5EP56381 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms