Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX9P55771 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX9P55771 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX9P55771 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX9P55771 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX9P55771 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX9P55771 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX9P55771 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX9P55771 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX9P55771 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX9P55771 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX9P55771 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX9P55771 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX9P55771 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX9P55771 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PAX9P55771 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAX9P55771 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAX9P55771 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAX9P55771 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms