Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CASP9P55211 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CASP9P55211 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CASP9P55211 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP9P55211 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP9P55211 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP9P55211 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP9P55211 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP9P55211 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP9P55211 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP9P55211 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP9P55211 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP9P55211 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP9P55211 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CASP9P55211 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP9P55211 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP9P55211 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP9P55211 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP9P55211 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP9P55211 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP9P55211 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP9P55211 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP9P55211 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP9P55211 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CASP9P55211 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP9P55211 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP9P55211 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP9P55211 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP9P55211 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP9P55211 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP9P55211 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP9P55211 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP9P55211 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP9P55211 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP9P55211 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP9P55211 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP9P55211 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms