Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFDNP55196 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
AFDNP55196 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFDNP55196 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFDNP55196 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFDNP55196 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFDNP55196 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AFDNP55196 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFDNP55196 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFDNP55196 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFDNP55196 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFDNP55196 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFDNP55196 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFDNP55196 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFDNP55196 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFDNP55196 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFDNP55196 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFDNP55196 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFDNP55196 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFDNP55196 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AFDNP55196 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AFDNP55196 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFDNP55196 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AFDNP55196 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFDNP55196 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFDNP55196 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFDNP55196 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFDNP55196 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFDNP55196 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFDNP55196 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFDNP55196 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AFDNP55196 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFDNP55196 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFDNP55196 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFDNP55196 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AFDNP55196 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AFDNP55196 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AFDNP55196 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AFDNP55196 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AFDNP55196 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AFDNP55196 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AFDNP55196 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
AFDNP55196 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AFDNP55196 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AFDNP55196 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
AFDNP55196 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AFDNP55196 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
AFDNP55196 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
AFDNP55196 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFDNP55196 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFDNP55196 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFDNP55196 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
AFDNP55196 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFDNP55196 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFDNP55196 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFDNP55196 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFDNP55196 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFDNP55196 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AFDNP55196 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFDNP55196 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFDNP55196 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFDNP55196 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFDNP55196 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFDNP55196 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AFDNP55196 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AFDNP55196 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms