Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAD23AP54725 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAD23AP54725 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms