Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP5P51878 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP5P51878 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP5P51878 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP5P51878 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP5P51878 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP5P51878 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP5P51878 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP5P51878 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP5P51878 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP5P51878 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP5P51878 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP5P51878 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP5P51878 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP5P51878 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP5P51878 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP5P51878 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP5P51878 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP5P51878 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP5P51878 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP5P51878 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP5P51878 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP5P51878 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP5P51878 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP5P51878 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP5P51878 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP5P51878 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP5P51878 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP5P51878 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP5P51878 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP5P51878 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP5P51878 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP5P51878 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP5P51878 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP5P51878 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP5P51878 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP5P51878 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP5P51878 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP5P51878 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP5P51878 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP5P51878 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP5P51878 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASP5P51878 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CASP5P51878 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP5P51878 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP5P51878 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP5P51878 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP5P51878 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP5P51878 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP5P51878 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP5P51878 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CASP5P51878 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms