Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms