Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB28P51157 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB28P51157 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB28P51157 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB28P51157 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB28P51157 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB28P51157 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB28P51157 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB28P51157 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB28P51157 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB28P51157 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB28P51157 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB28P51157 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB28P51157 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB28P51157 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB28P51157 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB28P51157 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB28P51157 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB28P51157 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB28P51157 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB28P51157 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB28P51157 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB28P51157 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB28P51157 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB28P51157 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB28P51157 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB28P51157 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB28P51157 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB28P51157 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB28P51157 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB28P51157 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB28P51157 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB28P51157 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB28P51157 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB28P51157 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB28P51157 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB28P51157 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB28P51157 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms