Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK7P50613 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK7P50613 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK7P50613 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK7P50613 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK7P50613 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK7P50613 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK7P50613 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK7P50613 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK7P50613 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK7P50613 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK7P50613 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK7P50613 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK7P50613 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK7P50613 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK7P50613 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK7P50613 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK7P50613 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK7P50613 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK7P50613 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK7P50613 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK7P50613 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK7P50613 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK7P50613 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK7P50613 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK7P50613 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK7P50613 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK7P50613 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK7P50613 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK7P50613 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK7P50613 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK7P50613 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK7P50613 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK7P50613 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK7P50613 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK7P50613 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK7P50613 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK7P50613 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK7P50613 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK7P50613 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK7P50613 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK7P50613 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK7P50613 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK7P50613 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms