Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CRIP1P50238 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRIP1P50238 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRIP1P50238 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRIP1P50238 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CRIP1P50238 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRIP1P50238 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRIP1P50238 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CRIP1P50238 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CRIP1P50238 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CRIP1P50238 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CRIP1P50238 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms