Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRIM1P49642 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms