Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AMPHP49418 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AMPHP49418 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AMPHP49418 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AMPHP49418 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AMPHP49418 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
AMPHP49418 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AMPHP49418 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPHP49418 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMPHP49418 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMPHP49418 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMPHP49418 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMPHP49418 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMPHP49418 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMPHP49418 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMPHP49418 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMPHP49418 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMPHP49418 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMPHP49418 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMPHP49418 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMPHP49418 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMPHP49418 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMPHP49418 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AMPHP49418 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AMPHP49418 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AMPHP49418 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPHP49418 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPHP49418 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPHP49418 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPHP49418 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPHP49418 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPHP49418 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPHP49418 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPHP49418 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPHP49418 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPHP49418 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPHP49418 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPHP49418 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPHP49418 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPHP49418 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPHP49418 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPHP49418 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMPHP49418 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMPHP49418 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMPHP49418 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMPHP49418 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMPHP49418 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMPHP49418 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMPHP49418 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms