Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LMAN1P49257 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMAN1P49257 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms