Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PXNP49023 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PXNP49023 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PXNP49023 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PXNP49023 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PXNP49023 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PXNP49023 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PXNP49023 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms