Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPL29P47914 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPL29P47914 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPL29P47914 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL29P47914 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL29P47914 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL29P47914 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL29P47914 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL29P47914 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPL29P47914 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms