Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UTRNP46939 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UTRNP46939 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTRNP46939 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTRNP46939 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTRNP46939 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTRNP46939 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTRNP46939 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTRNP46939 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UTRNP46939 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTRNP46939 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTRNP46939 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTRNP46939 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTRNP46939 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTRNP46939 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTRNP46939 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTRNP46939 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTRNP46939 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTRNP46939 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTRNP46939 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTRNP46939 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UTRNP46939 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UTRNP46939 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UTRNP46939 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UTRNP46939 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UTRNP46939 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UTRNP46939 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UTRNP46939 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTRNP46939 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTRNP46939 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTRNP46939 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTRNP46939 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTRNP46939 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTRNP46939 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTRNP46939 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTRNP46939 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTRNP46939 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTRNP46939 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTRNP46939 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTRNP46939 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTRNP46939 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UTRNP46939 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UTRNP46939 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms