Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR1P43307 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR1P43307 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR1P43307 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR1P43307 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR1P43307 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR1P43307 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR1P43307 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR1P43307 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR1P43307 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR1P43307 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR1P43307 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR1P43307 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR1P43307 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSR1P43307 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSR1P43307 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SSR1P43307 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SSR1P43307 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR1P43307 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR1P43307 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR1P43307 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR1P43307 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR1P43307 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR1P43307 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR1P43307 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR1P43307 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR1P43307 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR1P43307 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR1P43307 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR1P43307 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR1P43307 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSR1P43307 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSR1P43307 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSR1P43307 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms