Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC1P41238 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms